Comparaison des tests génétiques

0 Comments

Il est important de choisir le panel de tests selon les besoins de la race. Pour ce faire, je vous présente une comparaison des panels de tests génétiques disponibles : Optimal Selection et CatScan. Les tests disponibles à la pièce chez University of California (UC Davis) sont aussi indiqués à titre de comparatif.

TraitsGène
Couleurs et patrons
Agouti (solide et charchoal) - Locus AASIP
Brun/Chocolat/Cannelle - Locus BTYRP
Coloration (pointé et mink) et albinisme - Locus CTYR
Coloration (mocha) - Locus C, Allèle cmTYR
Dilution - Locus DMLPH
Extension (Ambre et Russet) - Locus EMC1R
Gants blancs (Birman)KIT
GlitterFGFR2
Golden/Sunshine (Sibériens) - Allèle vwbSIB (variable wideband)CORIN
Ticked - Locus TiDKK4
Tabby - Locus McLVRN
Taches blanches (white soptting) et blanc dominant (Dominant white) - Locus W KIT
Caractéristiques morphologiques
Poil frisé (Rex de Cornouailles)LPAR6
Poil frisé (Rex du Devonshire)KRT71
Poil frisé (Selkirk Rex)KRT71
Poil nu (Sphynx)KRT71
Poil long - Locus L (4 variants)FGF5
Poil Lykoi*HR
Oreilles pliées avec ostéochondrodysplasieTRPV4
Polydactylie (3 variants)LIMBR1
Queue courte (Bobtail Japonais)HES7
Queue courte (Manx, C1199del)**T-Box
Queue courte (Manx, T988del)**T-Box
Queue courte (Manx, T1169del)**T-Box
Groupes sanguins
b1 (Groupe B)CMAH
b2 (Groupe B)CMAH
b3 (Groupe B)CMAH
ac (Groupe AB)CMAH
Maladies génétiques
Acute Intermittent Porphyria (Porphyrie aiguë intermittente), Variant 1HMBS
Acute Intermittent Porphyria (Porphyrie aiguë intermittente), Variant 2HMBS
Acute Intermittent Porphyria (Porphyrie aiguë intermittente), Variant 3HMBS
Acute Intermittent Porphyria (Porphyrie aiguë intermittente), Variant 4 (Siamois Type 1)HMBS
Acute Intermittent Porphyria (Porphyrie aiguë intermittente), Variant 5 (Siamois Type 2)HMBS
Acute Intermittent Porphyria (Porphyrie aiguë intermittente), Variant 6HMBS
Alpha MannosidosisMAN2B1
Autoimmune Lymphoproliferative Syndrome (Syndrome lymphoprolifératif autoimmun)FASL
Brachycephalie (Burmese head defect)ALX1
Chediak-Higashi Syndrome (Découvert chez le Persans)LYST
Congenital Adrenal Hyperplasia (Hyperplasie congénitale des surrénales)CYP11B1
Congenital Erythropoietic Porphyria (Porphyrie érythropoïétique congénitale), Variant 1UROS
Congenital Erythropoietic Porphyria (Porphyrie érythropoïétique congénitale), Variant 2UROS
Congenital Hypothyroidism (Hypothyroïdie congénitale)TPO
Congenital Myasthenic Syndrome (Syndrome myasthénique congénital)COLQ
Cystinuria (Cystinurie), Type 1ASCL7A9
Cystinuria (Cystinurie), Type B, Variant 1SCL7A9
Cystinuria (Cystinurie), Type B, Variant 2SCL7A9
Cystinuria (Cystinurie), Type B, Variant 3SCL7A9
Cystinuria (Cystinurie), Type B, Variant 4SCL7A9
Cystinuria (Cystinurie), Type B, Variant 5SCL7A9
Dihydropyrimidinase Deficiency (Dihydropyrimidinurie)DPYS
Epidermolysis Bullosa SimplexKRT14
Factor XII Deficiency (Déficience en facteur XII), Variant 1FXII
Factor XII Deficiency (Déficience en facteur XII), Variant 2FXII
Factor XII Deficiency, Variant 3FXII
Feline Immunodeficiency Virus (FIV) Infection Risk ModifierAPOBEC3C
Feline Leukocyte Adhesion Deficiency (Déficit d'adhésion leucocytaire félin), Type 1ITGB2
Feline Spongy EncephalopathyASPA
Forebrain Commissural MalformationGDF7
Glutaric Aciduria (Acidurie glutarique) Type IIETFDH
Glycogen Storage Disease (Maladie du stockage du glycogène), Type IVGBE1
GM1 Gangliosidosis (Gangliosidose)GLB1
GM2A Gangliosidosis (Gangliosidose)GM2A
GM2 Gangliosidosis (Gangliosidose), Type II (domestique à poil court)HEXB
GM2 Gangliosidosis (Gangliosidose), Type II (Burmese)HEXB
GM2 Gangliosidosis (Gangliosidose), Type II (domestique Japonais)HEXB
GM2 Gangliosidosis (Gangliosidose), Type II (Korat)HEXB
Hemophilia B (Hémophilie B), Variant 1F9
Hemophilia B (Hémophilie B), Variant 2F9
Hyperlipoproteinemia - Lipoprotein Lipase Deficiency (Déficit en lipoprotéine lipase)LPL
Hypertrophic Cardiomyopathy (Cardiomyopathie hypertrophique, Maine Coon)MYBPC
Hypertrophic Cardiomyopathy (Cardiomyopathie hypertrophique, Ragdoll)MYBPC
Hypertrophic Cardiomyopathy (Cardiomyopathie hypertrophique, Sphynx)ALMS1
Hypogonadotropic HypogonadismTAC3
Hypokalemic Periodic Paralysis - Episodic Hypokalemic Polymyopathy (Paralysie hypokaliémique)WNK4
Inflammatory Linear Verrucous Epidermal NevusNSDHL
Hypotrichosis with Short Life Expectancy (Hypotrichose)FOXN1
L-2-Hydroxyglutaric AciduriaL2HGDH
Methemoglobinemia, Variant 1CYB5R3
Methemoglobinemia, Variant 2CYB5R3
Mucolipidosis IIGNPTAB
Mucopolysaccharidosis (Mucopolysaccharidose) Type IIDUA
Mucopolysaccharidosis (Mucopolysaccharidose) Type VI (Forme moyenne)ARSB
Mucopolysaccharidosis (Mucopolysaccharidose) Type VI modifié (Severe Forme sévère - Siamois)ARSB
Mucopolysaccharidosis (Mucopolysaccharidose) Type VII, Variant 1GUSB
Mucopolysaccharidosis (Mucopolysaccharidose) Type VII, Variant 2GUSB
Multiple Drug Resistance - MDR1 Medication Sensitivity (Résistance multiple aux médicaments)ABCB1
Myotonia Congenita (Myotonie congénitale)CLCN1
Neuronal Ceroid Lipofuscinosis 6CLN6
Neuronal Ceroid Lipofuscinosis 7, Variant 1MFSD8
Neuronal Ceroid Lipofuscinosis 7, Variant 2MFSD8
Niemann-Pick C1 Disease, Variant 1 (Sphingomyelinosis)NPC1 
Niemann-Pick C1 Disease, Variant 2NPC1 
Niemann-Pick C2 Disease (Sphingomyelinosis)NPC2 
Oculocutaneous AlbinismHPS5
Polycystic Kidney Disease (Maladie polykystique rénale)PKD1
Polycystic Kidney Disease (Sibériens))PKD2
Primary Congenital GlaucomaLTBP2
Primary Hyperoxaluria (Hyperoxalurie primaire) Type IIGRHPR
Progressive retinal atrophy (Atrophie rétinienne progressive - Abyssin, PRA rdAc)CEP290
Progressive retinal atrophy - Rod-Cone Dysplasia (Atrophie rétinienne progressive - Abyssin, PRA Rdy)CRX
Progressive retinal atrophy (Atrophie rétinienne progressive - Bengal, PRA-b)KIF3B
Progressive retinal atrophy (Atrophie rétinienne progressive - Persan, PRA-pd)AIPL1
Pyruvate Kinase Deficiency (Déficit en pyruvate kinase)PKLR
Spinal Muscular Atrophy (Atrophie musculaire spinale)LIX1
Vitamin D-dependent Rickets (Rachitisme dépendant de la vitamine D), Type IA, Variant 1CYP27B1
Vitamin D-dependent Rickets (Rachitisme dépendant de la vitamine D), Type IA, Variant 2CYP27B1
Vitamin D-Dependent Rickets Type IBCYP2R1

Mise à jour : 16 novembre 2023


* Il y a six mutations identifiées sur le gène HR responsables du phénotype du poil Lykoï. Seulement deux mutations sont disponibles dans l’Optimal Selection (CA et VA). Les six mutations sont disponibles dans CatScan.

** Il y a quatre mutations identifiées sur le gène T-Box responsables du phénotype de la queue coute. Seulement deux mutations sont disponibles dans l’Optimal Selection et trois mutations dans CatScan. Le test de la T-Box est également disponible en recherche à l’University of Missouri en collaboration avec UC Davis.

Le test pour le silver/smoke (locus Inhibition) de même que pour le orange/roux (locus O) sont disponibles en recherche seulement à l’University of Missouri en collaboration avec UC Davis (en plus du locus A, B, C, D, E, poil long, glitter, blanc/white spotting/gants blancs, tabby, ticked, sunshine/golden, queue courte des Manx).

Categories:

Laisser un commentaire

Votre adresse e-mail ne sera pas publiée. Les champs obligatoires sont indiqués avec *